無論是手機POS機還是不同品牌的傳統POS機，區別一般都是以下幾點：
辦理所需要提供的資料的區別：營業執照、開戶許可證、稅務登記證、組織機構代碼證和法人身份證、法人銀行卡等；有些第三方支付公司未為了服務個體經營戶，也可以不用提供稅務登記證和組織機構代碼證等；
費率的區別：不同的行業有不同的POS機費率，比如批發行業可以辦26封頂的機器、一般經營行業可以辦0.78%費率，餐飲行業可以辦1.25%等
到賬時間的區別：一般分為當天到賬、1個工作日到賬和2個工作日到賬等，也就是俗稱的T 0、T 1、T 2，這里說的是工作日，也有銀行可以在節假日到賬，如交通銀行。
刷卡額度的限制：不同銀行的POS機有不同的規定，我接觸到的有些商戶，辦理交通銀行的POS機，刷卡的額度單筆只能到5000元。
對私對公入賬不同：大部分銀行都是對公賬戶，須按對公業務才能動用公司的錢，第三方支付機構的POS機大部分都是進對私賬戶，到賬后持卡人就可以操作資金了。
目前手機POS機在市場上開始普及，形成了幾大品牌，像匯刷（易刷）、錢袋寶（微金）、快錢、移網快付，拉卡拉也可以做手機收款，但是僅限儲蓄卡，并只能在10張銀行卡間操作，嚴格說來手機拉卡拉不算是手機POS機，這些產品的共同點是他們的價格都比傳統POS機低。他們的辦理條件有所不同，快錢和錢袋寶（微金）需要營業執照才能開通商戶版；易刷和移網快付需要身份證和銀行卡；費率也有所不同，易刷是1%，錢袋寶和微金是0.78%，快錢的是根據行業不同有不同的費率，移網快付是0.6%；刷卡方式也不盡相同，易刷和錢袋寶使用密碼和電子簽名，快錢和移網快付使用銀行發送的動態驗證碼；另外一點是易刷、錢袋寶、快錢的手機POS機都是一人使用，移網快付的手機POS機相當于收款系統，可以同時多人使用。